Her står fagordene fra kapitel A7, DNA’s kemi , i den rækkefølge, de kommer i afsnittene. Tryk på et fagord for at komme hen til det sted i bogen, hvor det bliver forklaret.
A7.1 Nucleotider
nucleotid Byggestenen i DNA. Den har tre dele: en phosphatgruppe, et sukker og en base.
deoxyribose Sukkeret i DNA. Det er et monosaccharid med fem carbonatomer, som mangler et oxygenatom på carbonatom 2′.
ribose Sukkeret i RNA. På carbonatom 2′ har det et oxygenatom, som sukkeret i DNA mangler.
base Den del af et nucleotid, der består af en eller to flade ringe med nitrogenatomer. DNA har fire forskellige: A, T, G og C.
purin Base med to ringe, der er bygget sammen. Adenin og guanin hører til her.
pyrimidin Base med kun én ring. Cytosin, thymin og uracil hører til her.
adenin Purin med en aminogruppe på ringen. Forkortes A og parrer med thymin.
guanin Purin med en carbonylgruppe og en aminogruppe på ringen. Forkortes G og parrer med cytosin.
cytosin Pyrimidin med en aminogruppe og en carbonylgruppe på ringen. Forkortes C og parrer med guanin.
thymin Pyrimidin med to carbonylgrupper og en methylgruppe på ringen. Forkortes T og findes i DNA, men ikke i RNA.
uracil Pyrimidin med to carbonylgrupper på ringen. Forkortes U og sidder i RNA på den plads, thymin har i DNA.
phosphatgruppe Den sure del af et nucleotid, som er negativt ladet ved pH 7. Den er bundet til carbonatom 5′ i sukkeret med en esterbinding.
A7.2 DNA-strengen
phosphodiesterbinding Holder to nucleotider sammen i en DNA-streng. En phosphatgruppe er bundet til to sukkergrupper med en esterbinding til hver side.
rygrad Kæden af skiftevis sukker og phosphat i en DNA-streng. Baserne stikker ud til siden fra den.
5′-ende Der, hvor en DNA-streng slutter med en phosphatgruppe på carbonatom 5′. En sekvens skrives altid herfra.
3′-ende Der, hvor en DNA-streng slutter med en fri OH-gruppe på carbonatom 3′. Her kan det næste nucleotid sættes på.
sekvens Rækkefølgen af baser i en streng. Den skrives altid fra 5′-enden til 3′-enden, for eksempel 5′-ATGC-3′.
gelelektroforese Metode, der sorterer stykker af DNA efter længde. Spænding trækker det negativt ladede DNA gennem et net af lange molekyler, og korte stykker vandrer længst.
A7.3 Baseparring og dobbeltspiralen
basepar Adenin og thymin eller guanin og cytosin, som sidder over for hinanden i hver sin streng. De holdes sammen af hydrogenbindinger.
baseparring Reglen om, hvem der hører sammen i DNA: adenin med thymin og guanin med cytosin.
komplementær Siges om to strenge, hvor der over for hvert A i den ene sidder et T i den anden. Over for hvert G sidder et C.
dobbeltspiral Den form, DNA har, når to strenge snor sig om hinanden. Rygraden vender ud mod vandet, og baserne ligger stablet i midten.
hydrogenbinding Tiltrækning mellem et H på N eller O i én gruppe og et ledigt elektronpar i en anden. Den første gruppe giver, og den anden tager imod.
londonbindinger Den svageste slags tiltrækning. Den findes mellem alle grupper, også upolære, og holder baseparrene i DNA stablet som mønter i en rulle.
A7.4 Når DNA smelter
smeltning Det, der sker, når en opløsning af DNA varmes op, og de to strenge går fra hinanden. Intet bliver flydende.
smeltetemperatur Så varm skal en opløsning af DNA være, før halvdelen af dobbeltstrengene er skilt ad. Symbolet er T m .
hårnål En enkelt streng, hvis to ender er komplementære, så den folder sig sammen med sig selv.
smeltekurve Graf over absorbansen ved 260 nm som funktion af temperaturen. Absorbansen stiger med omkring 37 %, når de to strenge i DNA skilles.
A7.5 PCR: kopiering i et reagensglas
PCR Metode, der på et par timer laver en milliard kopier af et bestemt stykke DNA. Temperaturen skifter mellem tre trin igen og igen.
DNA-polymerase Enzym, som cellen kopierer sit DNA med. Det sætter ét nucleotid ad gangen på 3′-enden af en streng, der sidder på en skabelonstreng.
skabelonstreng Den kæde af nucleotider, som DNA-polymerase aflæser. Enzymet sætter det nucleotid på, der passer til den næste base: G over for C og A over for T.
primer Kort enkeltstreng på omkring 20 nucleotider. Den er komplementær til begyndelsen af det stykke, der skal kopieres, og enzymet bygger videre på dens 3′-ende.
cyklus Én omgang i PCR med tre trin: 95 °C, omkring 55 °C og 72 °C. Antallet af kopier fordobles hver gang.
A7.6 Fra DNA til protein
transskription Første trin fra DNA til protein. Et enzym bygger en streng af mRNA, som er komplementær til den ene af de to strenge i DNA.
mRNA Enkelt streng med ribose som sukker og uracil i stedet for thymin. Den er en arbejdskopi af et stykke DNA og læses, når et protein skal bygges.
kodende streng Den af de to kæder i DNA, som har samme sekvens som mRNA, blot med T i stedet for U.
translation Andet trin fra DNA til protein. mRNA læses tre baser ad gangen, og aminosyrerne bindes sammen med peptidbindinger.
codon Tre baser i træk i mRNA. Tilsammen står de for én aminosyre eller for et stopsignal.
mutation En ændring i sekvensen i DNA. Skiftes én base ud, kan proteinet få en anden aminosyre med en anden sidekæde.
A7.7 Skader på DNA og lægemidler
thymindimer To T-baser ved siden af hinanden i samme streng, som ultraviolet lys har bundet sammen. Det sker ved en addition, og dobbeltspiralen får en bule.
cisplatin Lægemiddel mod kræft, som er et kompleks med ammoniak og chloridioner som ligander. Inde i cellen låser det to guaninbaser i DNA sammen.
AZT Lægemiddel mod hiv, der ligner et nucleotid, men mangler OH-gruppen på carbonatom 3′. Bygges det ind, kan strengen ikke blive længere.